Probe the cache for entries found by bfcquery using the given query.
Source:R/quickOnto.R
quickOnto.Rd
Probe the cache for entries found by bfcquery using the given query.
Usage
quickOnto(query, cache = BiocFileCache::BiocFileCache(), qans.only = FALSE)
Note
Take only the last entry found if there are multiple hits. Use `setup_entities2` to transform owl to ontologyIndex and cache the result if this is absent for the owl identified by query.
Examples
aeo = quickOnto("aeo.owl")
#> multiple hits, returning last
str(aeo)
#> List of 6
#> $ id : Named chr [1:250] "AEO_0000013" "CARO_0000043" "AEO_0000078" "AEO_0000221" ...
#> ..- attr(*, "names")= chr [1:250] "AEO_0000013" "CARO_0000043" "AEO_0000078" "AEO_0000221" ...
#> $ name : Named chr [1:250] "single-cell tissue" "simple tissue" "lumen of tube" "open anatomical space" ...
#> ..- attr(*, "names")= chr [1:250] "AEO_0000013" "CARO_0000043" "AEO_0000078" "AEO_0000221" ...
#> $ parents :List of 250
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#> ..$ CL_0000527 : chr "CL_0000540"
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